Library Installationen
- Numerical Recipes installiert unter:
/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90
- Qhull-Library installiert unter:
/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod
- NetCDF-Installationen:
netCDF 3.6.3: /usr/local/netcdf/v3.6.3
netCDF 4.0.1 (mit parallelem I/O):
/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local
(Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und
/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)JSC-Installation von netCDF 4.0.1:
HDF5 1.8.3 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.3 (mit parallelem I/O, s. /usr/local/hdf5/v1.8.3/lib/libhdf5.settings)
NetCDF 4.0.1 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.0.1
- Utils-Library installiert unter:
mit netCDF 3.6.3: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils
mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4
Nutzung der Libraries in CLaMS
Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.
- mit netCDF 3.6.3:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod
- mit netCDF 4.0.1
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4
- mit netCDF 4.0.1 (JSC-Installation):
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4_jsc
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4_jsc
Änderungen im Makefile
Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert und eingecheckt (Version 1.7). Es wird mit netCDF Version 3.6.3 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:
baseDir := $(HOME)/../jicg1108 libDir := $(baseDir)/clams_lib modDir := $(baseDir)/clams_mod netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf
Für die Compilation mit netCDF4 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:
baseDir := $(HOME)/../jicg1108 libDir := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4 modDir := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4 netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz