Differences between revisions 9 and 10
⇤ ← Revision 9 as of 2014-03-18 09:47:16 →
Size: 2254
Editor: NicoleThomas
Comment:
← Revision 10 as of 2014-03-19 09:07:22 → ⇥
Size: 1723
Editor: NicoleThomas
Comment:
Deletions are marked like this. Additions are marked like this.
Line 12: Line 12:
 * NetCDF-Installationen:  * NetCDF-Installation:
Line 16: Line 16:
  * JSC-Installation von netCDF 4.0.1: <<BR>>
  HDF5 1.8.4 installiert unter ''/usr/local/hdf5/v1.8.4'' <<BR>>
  NetCDF 4.0.1 installiert unter ''/usr/local/netcdf/v4.0.1 ''
Line 41: Line 37:
 * mit netCDF 4.0.1:
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod
Line 57: Line 50:

Für die Compilation mit netCDF4.0.1 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

 {{{
libDir := $(baseDir)/clams_lib
modDir := $(baseDir)/clams_mod
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz
 }}}

JUROPA

Library Installationen

  • Numerical Recipes installiert unter:

    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90

  • Qhull-Library installiert unter:

    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod

  • NetCDF-Installation:

    • JSC-Installation von netCDF 4.2:
      HDF5 1.8.9 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.9_serial
      NetCDF 4.2 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.2

  • Utils-Library installiert unter:

    • mit netCDF 4.2: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_netcdf4.2

    • mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils

Hilfsprogramme

Die Programme ncdump, ncgen und bm_file sind verlinkt nach:

  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local/bin

Die NCO-Routinen sind unter /usr/local/bin verlinkt.

Nutzung der Libraries in CLaMS

Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.

  • mit netCDF 4.2:
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4.2
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4.2

Änderungen im Makefile

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert. Es wird mit netCDF Version 4.2 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt: 

  • baseDir := /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108

libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4.2
modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4.2
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz -lcurl

Juropa/Libraries (last edited 2014-03-19 09:07:39 by NicoleThomas)