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= JUROPA =

JUROPA

Library Installationen

  • Numerical Recipes installiert unter:
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90

  • Qhull-Library installiert unter:
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod

  • NetCDF-Installationen:
    • JSC-Installation von netCDF 4.2:
      HDF5 1.8.9 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.9_serial
      NetCDF 4.2 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.2

    • JSC-Installation von netCDF 4.0.1:
      HDF5 1.8.4 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.4
      NetCDF 4.0.1 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.0.1

  • Utils-Library installiert unter:
    • mit netCDF 4.2: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_netcdf4.2

    • mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils

Hilfsprogramme

Die Programme ncdump, ncgen und bm_file sind verlinkt nach:

  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local/bin

Die NCO-Routinen sind unter /usr/local/bin verlinkt.

Nutzung der Libraries in CLaMS

Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.

  • mit netCDF 4.2:
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4.2
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4.2
  • mit netCDF 4.0.1:
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
    • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod

Änderungen im Makefile

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert. Es wird mit netCDF Version 4.2 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

  • baseDir := /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108
    
    libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4.2
    modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4.2
    netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz -lcurl

Für die Compilation mit netCDF4.0.1 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

  • libDir  := $(baseDir)/clams_lib
    modDir  := $(baseDir)/clams_mod
    netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz 

Juropa/Libraries (last edited 2014-03-19 09:07:39 by NicoleThomas)