Library Installationen

• Numerical Recipes installiert unter:

  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90

• Qhull-Library installiert unter:

  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod

• NetCDF-Installationen:

  • netCDF 3.6.3: /usr/local/netcdf/v3.6.3

  • netCDF 4.0.1 (mit parallelem I/O):
    /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local
    (Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und
    /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)

  • JSC-Installation von netCDF 4.0.1:
    HDF5 1.8.3 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.3 (mit parallelem I/O, s. /usr/local/hdf5/v1.8.3/lib/libhdf5.settings)
    NetCDF 4.0.1 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.0.1

• Utils-Library installiert unter:

  • mit netCDF 3.6.3: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils

  • mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4

Hilfsprogramme

Die Programme ncdump, ncgen und bm_file sind verlinkt nach:

• /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local/bin

Die NCO-Routinen müssen ebenfalls von dort genommen werden, da die NCO-Routinen unter /usr/local/bin noch nicht mit netCDF-4 erstellt wurden.

Nutzung der Libraries in CLaMS

Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.

• mit netCDF 3.6.3:
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod
• mit netCDF 4.0.1
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4
• mit netCDF 4.0.1 (JSC-Installation):
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4_jsc
  • /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4_jsc

Änderungen im Makefile

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert und eingecheckt (Version 1.7). Es wird mit netCDF Version 3.6.3 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

• baseDir := $(HOME)/../jicg1108
  libDir  := $(baseDir)/clams_lib
  modDir  := $(baseDir)/clams_mod
  netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf

Für die Compilation mit netCDF4 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

• baseDir := $(HOME)/../jicg1108
  libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4
  modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4
  netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz