Diff for "Juropa/Libraries"

Differences between revisions 1 and 8 (spanning 7 versions)

Library Installationen

Numerical Recipes installiert unter:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90
Qhull-Library installiert unter:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod
NetCDF-Installationen:
- JSC-Installation von netCDF 4.2:
  HDF5 1.8.9 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.9_serial
  NetCDF 4.2 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.2
- JSC-Installation von netCDF 4.0.1:
  HDF5 1.8.4 installiert unter /usr/local/hdf5/v1.8.4
  NetCDF 4.0.1 installiert unter /usr/local/netcdf/v4.0.1
Utils-Library installiert unter:
- mit netCDF 4.2: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_netcdf4.2
- mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils

Hilfsprogramme

Die Programme ncdump, ncgen und bm_file sind verlinkt nach:

/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local/bin

Die NCO-Routinen sind unter /usr/local/bin verlinkt.

Nutzung der Libraries in CLaMS

Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.

mit netCDF 4.2:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4.2
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4.2
mit netCDF 4.0.1:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod

Änderungen im Makefile

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert. Es wird mit netCDF Version 4.2 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

baseDir := /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108

libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4.2
modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4.2
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz -lcurl

Für die Compilation mit netCDF4.0.1 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

libDir  := $(baseDir)/clams_lib
modDir  := $(baseDir)/clams_mod
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz

-  ⇤ ← Revision 1 as of 2010-03-19 09:11:34 → 
  Size: 1365
  Editor: NicoleThomas
  Comment:
+   ← Revision 8 as of 2014-03-18 09:07:54 → ⇥
  Size: 2240
  Editor: NicoleThomas
  Comment:
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 1:
+## page was renamed from JuropaLibs
-Line 4:
+Line 5:
-  /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90
+  ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90''
-Line 7:
+Line 8:
-   /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod
+   ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod''
-Line 10:
+Line 11:
-  * Vers. 3.6.3: unter /usr/local/netcdf/v3.6.3
  * Vers. 4.0.1 (mit hdf5 1.8.2 und parallelem I/O): unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local 
   (Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)
  * JSC-Installation von Vers. 4.0.1: unter /user/local/netcdf/v4.0.1)
+  * JSC-Installation von netCDF 4.2: <<BR>>
  HDF5 1.8.9 installiert unter ''/usr/local/hdf5/v1.8.9_serial'' <<BR>>
  NetCDF 4.2 installiert unter ''/usr/local/netcdf/v4.2 ''
  * JSC-Installation von netCDF 4.0.1: <<BR>>
  HDF5 1.8.4 installiert unter ''/usr/local/hdf5/v1.8.4'' <<BR>>
  NetCDF 4.0.1 installiert unter ''/usr/local/netcdf/v4.0.1 ''
-Line 17:
+Line 20:
-  * mit netCDF 3.6.3 unter: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils
  * mit netCDF 4.0.1 unter: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4
+  * mit netCDF 4.2: ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_netcdf4.2''
  * mit netCDF 4.0.1: ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils''

== Hilfsprogramme ==

Die Programme '''ncdump''', '''ncgen''' und '''bm_file''' sind verlinkt nach: 

  /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local/bin

Die '''NCO'''-Routinen sind unter /usr/local/bin verlinkt.
-Line 24:
+Line 35:
- * mit netCDF 3.6.3:
+ * mit netCDF 4.2:
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4.2
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4.2

 * mit netCDF 4.0.1:
-Line 28:
+Line 43:
- * mit netCDF 4.0.1
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4
+== Änderungen im Makefile ==
-Line 32:
+Line 45:
- * mit netCDF 4.0.1  (JSC-Installation):
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4_jsc
  * /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4_jsc
+Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde '''mkincl/config/config.Linux_ifc''' erweitert.
Es wird mit netCDF Version 4.2 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

 {{{
baseDir	:= /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108

libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4.2
modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4.2
netcdf_lib_file	= -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz -lcurl
 }}}

Für die Compilation mit netCDF4.0.1 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

 {{{
libDir  := $(baseDir)/clams_lib
modDir  := $(baseDir)/clams_mod
netcdf_lib_file	= -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz -lsz 
 }}}