Diff for "Juropa/Libraries"

Differences between revisions 1 and 2

Library Installationen

Numerical Recipes installiert unter:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90
Qhull-Library installiert unter:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod
NetCDF-Installationen:
- Vers. 3.6.3: /usr/local/netcdf/v3.6.3
- Vers. 4.0.1 (mit hdf5 1.8.2 und parallelem I/O): /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local
  (Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und
  /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)
- JSC-Installation von Vers. 4.0.1: /usr/local/netcdf/v4.0.1
Utils-Library installiert unter:
- mit netCDF 3.6.3: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils
- mit netCDF 4.0.1: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4

Nutzung der Libraries in CLaMS

Alle in CLaMS genutzten Libraries und die hierzu benötigten Module-Files werden in jeweils ein Verzeichnis gelinkt, welches dann beim Compilieren und Linken angegeben wird.

mit netCDF 3.6.3:
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod
mit netCDF 4.0.1
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4
mit netCDF 4.0.1 (JSC-Installation):
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_lib_netcdf4_jsc
- /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/clams_mod_netcdf4_jsc

Änderungen im Makefile

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde mkincl/config/config.Linux_ifc erweitert und eingecheckt (Version 1.7). Es wird mit netCDF Version 3.6.3 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

baseDir := $(HOME)/../jicg1108
libDir  := $(baseDir)/clams_lib
modDir  := $(baseDir)/clams_mod
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf

Für die Compilation mit netCDF4 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

baseDir := $(HOME)/../jicg1108
libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4
modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4
netcdf_lib_file = -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz

-  ⇤ ← Revision 1 as of 2010-03-19 09:11:34 → 
  Size: 1365
  Editor: NicoleThomas
  Comment:
+   ← Revision 2 as of 2010-03-19 10:22:01 → ⇥
  Size: 2128
  Editor: NicoleThomas
  Comment:
-Deletions are marked like this.
+Additions are marked like this.
 Line 4:
-  /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90
+  ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/numrec-f90''
 Line 7:
-   /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod
+   ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/qhull-2.6-mod''
 Line 10:
-  * Vers. 3.6.3: unter /usr/local/netcdf/v3.6.3
  * Vers. 4.0.1 (mit hdf5 1.8.2 und parallelem I/O): unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local 
   (Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)
  * JSC-Installation von Vers. 4.0.1: unter /user/local/netcdf/v4.0.1)
+  * Vers. 3.6.3:  ''/usr/local/netcdf/v3.6.3''
  * Vers. 4.0.1 (mit hdf5 1.8.2 und parallelem I/O): ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/local'' <<BR>>
  (Sources unter /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/hdf5-1.8.2 und <<BR>>
  /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/netcdf-4.0.1)
  * JSC-Installation von Vers. 4.0.1: ''/usr/local/netcdf/v4.0.1''
-Line 17:
+Line 18:
-  * mit netCDF 3.6.3 unter: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils
  * mit netCDF 4.0.1 unter: /lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4
+  * mit netCDF 3.6.3: ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils''
  * mit netCDF 4.0.1: ''/lustre/jhome4/jicg11/jicg1108/utils_nc4''
-Line 35:
+Line 36:
+== Änderungen im Makefile ==

Für die Compilation der CLaMS-Pakete auf dem JUROPA mit dem Intel Compiler wurde '''mkincl/config/config.Linux_ifc''' erweitert und eingecheckt (Version 1.7).
Es wird mit netCDF Version 3.6.3 compiliert. Die entsprechenden Verzeichnisse werden in den folgenden Zeilen gesetzt:

 {{{
baseDir	:= $(HOME)/../jicg1108
libDir  := $(baseDir)/clams_lib
modDir  := $(baseDir)/clams_mod
netcdf_lib_file	= -L$(libDir) -lnetcdff -lnetcdf
 }}}

Für die Compilation mit netCDF4 müssen diese Zeilen wie folgt geändert werden:

 {{{
baseDir	:= $(HOME)/../jicg1108
libDir  := $(baseDir)/clams_lib_netcdf4
modDir  := $(baseDir)/clams_mod_netcdf4
netcdf_lib_file	= -L$(libDir) -lnetcdf -lhdf5_hl -lhdf5 -lz
 }}}